都是高校招生录取的特殊方式，是可以降低自己录取风险的录取捷径。
都有面试环节，都是可以以一个相对不那么高的高考分数进入一所理想名校的招生途径。
不同点：
产生背景：自主招生已实行多年，是多年积累下的产物，而“综合评价”是在2015年高考改革下产生的招录方式。
选拔对象：自主招生主要选拔以偏才怪才为主，注重学科特长和创新潜质能力的选拔，而综合评价的成绩由三部分构成：高考成绩+面试成绩+学业水平考试成绩，另外还要参考考生高中的综合素质评价信息，即高校更加注重考生的综合素质。
考核流程：自主招生是通过初审后，还要参加各个大学自己组织的笔试+面试，通过面试后，可以获得各种高考分数优惠政策，而综合评价是先参加高考，再通过学校自己划定的高考面试线后参加复旦交大的特色面试，最后合成各项成绩筛选出(高考成绩占60%，面试占30%，学业水平考试成绩占10%)最终的人选。 入围面试方式：很多高校是通过自己组织的笔试筛选进入面试，而综合评价则是参考高考成绩来筛选面试同学。
进行时间：自主招生的时间往年都是安排在高考前，今年高考改革后，自主招生安排在高考之后，高考成绩出分前进行。而“综合评价”的时间则是定在高考之后且是高考成绩出分之后，目的是为了参考高考成绩这一硬性指标来筛选面试人员。
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