经济适用房、小产权房与商住楼的区别在于含义不同。经济适用住房是指政府提供政策优惠、限定建设标准、供应对象和销售价格，具有保障性质的政策性商品住房。
小产权房是指由乡镇政府而不是国家颁发产权证的房产，在现实中往往是一些村集体组织或者开发商以新农村建设等名义出售的、建筑在集体土地上的房屋或是由农民自行组织建造的“商品房”。因此它并不真正构成严格法律意义上的产权。
商品房是指在市场经济条件下，具有经营资格的房地产开发公司(包括外商投资企业)通过出让方式取得土地使用权后经营的住宅，均按市场价出售。其价格由成本、税金、利润、代收费用以及地段、层次、朝向、质量、材料差价等组成。另外，从法律角度来分析，商品房是指按法律、法规及有关规定可在市场上自由交易，不受政府政策限制的各类商品房屋，包括新建商品房、二手房(存量房)等。商品房根据其销售对象的不同，可以分为外销商品房和内销商品房两种。
根据《经济适用住房管理办法》规定，经济适用住房在取得房屋所有权证和土地使用证一定年限后，可以按市场价上市出售;出售时，应当按照届时同地段普通商品住房与经济适用住房差价的一定比例向政府交纳收益，具体年限和比例由市、县人民政府确定。但这类交易存在很大的不确定性，因此在交易过程中，购买他人经济适用房应注意防范以下问题：
1、一房多卖的问题。如不能立即过户，具有一房多卖非法目的卖房人将获得充分时间，且不易被权利人查证。
2、长期无法过户的问题。私下交易的买卖双方具备交易条件的时间越长，交易的不稳定性越大，买方的交易风险就越大。
3、房款是否能被执行回来的问题。执行难对于存在于个人之间的二手房买卖而言更是如此。
4、投资利益上的问题。如不能及时过户使得买方可能因经济适用房税收等政策调整，不得不增加投资成本。